Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGO4Q9HCK5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGO4Q9HCK5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms