Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR88Q9GZN0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR88Q9GZN0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms