Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR3CQ9C0K3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms