Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ROPN1BQ9BZX4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms