Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA7Q9BWT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA7Q9BWT1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms