Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms