Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIK3R4Q99570 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms