Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms