Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms