Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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