Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP2Q96HF1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFRP2Q96HF1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms