Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 MXD3-209ENST00000513169 555 ntTSL 516.51■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EHMT1-208ENST00000475564 2782 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STX18-AS1-202ENST00000502693 724 ntTSL 316.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.225e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-216ENST00000520174 1057 ntTSL 516.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-207ENST00000529281 1310 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSD17B12-206ENST00000531185 611 ntTSL 416.34■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CNEP1R1-210ENST00000568890 1992 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 516.32■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 VRK2-204ENST00000428021 553 ntTSL 416.32■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT22-209ENST00000539325 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RBPJ-211ENST00000505958 758 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FAM169A-205ENST00000513277 803 ntTSL 316.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.197e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NPEPPS-220ENST00000533573 559 ntTSL 416.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DDX42-212ENST00000581135 589 ntTSL 416.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GLDC-217ENST00000639840 600 ntTSL 516.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-205ENST00000461568 1531 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TFR2-210ENST00000474947 1514 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-210ENST00000517804 813 ntTSL 516.12■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 416.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EIF2B5-212ENST00000491144 3038 ntTSL 216.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC010542.3-201ENST00000561527 586 ntTSL 416.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FCHSD1-206ENST00000522126 2577 ntTSL 216.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGRN1-204ENST00000536343 1575 ntTSL 216.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBE2E1-211ENST00000495141 582 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLCD3-205ENST00000543623 870 ntTSL 316.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZCCHC4-203ENST00000505451 1504 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PTPRK-208ENST00000392449 1456 ntTSL 216.01■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAPBPL-204ENST00000543567 1605 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-205ENST00000423577 677 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM168-204ENST00000447395 1291 ntTSL 215.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBE2E1-204ENST00000442670 622 ntTSL 215.89■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 415.88■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-213ENST00000541597 685 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-215ENST00000542389 618 ntTSL 415.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-208ENST00000564703 921 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYO18A-220ENST00000588791 650 ntTSL 515.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-215ENST00000519959 578 ntTSL 415.81■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COX10-203ENST00000580561 1384 ntTSL 215.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 187.9 ms