Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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