Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGDCC4Q8TDY8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGDCC4Q8TDY8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms