Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD2

SP7, Transcription factor Sp7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP7Q8TDD2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP7Q8TDD2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP7Q8TDD2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP7Q8TDD2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP7Q8TDD2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP7Q8TDD2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP7Q8TDD2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP7Q8TDD2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP7Q8TDD2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms