Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms