Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms