Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM43Q6ZSC3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms