Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPP4R4Q6NUP7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms