Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNS3Q68CZ2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms