Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms