Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms