Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO47Q5MNV8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO47Q5MNV8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms