Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms