Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HFEQ30201 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HFEQ30201 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HFEQ30201 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HFEQ30201 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms