Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP7Q16576 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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