Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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