Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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