Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GAPVD1Q14C86 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GAPVD1Q14C86 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
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