Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms