Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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