Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms