Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R1AQ13522 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms