Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF5Q13243 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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