Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms