Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
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