Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.497e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 RNF170-203ENST00000319104 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.517e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-214ENST00000519950 1060 ntTSL 311.84□□□□□ -0.517e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-232ENST00000523894 862 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.517e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.527e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-222ENST00000522170 853 ntTSL 311.81□□□□□ -0.527e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A9-207ENST00000555840 2377 ntTSL 211.76□□□□□ -0.537e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-210ENST00000580074 754 ntTSL 311.7□□□□□ -0.547e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.557e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 USP7-215ENST00000566273 577 ntTSL 411.61□□□□□ -0.557e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.557e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-206ENST00000578373 4523 ntTSL 1 (best)11.55□□□□□ -0.567e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.567e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A9-203ENST00000538956 1264 ntTSL 211.54□□□□□ -0.567e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TCEA3-203ENST00000450454 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.567e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.577e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.577e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PPARG-203ENST00000396999 1329 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.577e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 511.44□□□□□ -0.581e-7■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 ERBB2-218ENST00000584450 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.597e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.67e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CATSPERE-204ENST00000428042 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.67e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-215ENST00000519994 1148 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.627e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-206ENST00000517362 583 ntTSL 411.08□□□□□ -0.647e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 USP7-214ENST00000566224 503 ntTSL 311□□□□□ -0.657e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 TECR-215ENST00000598918 314 ntTSL 310.69□□□□□ -0.77e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.77e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.77e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NUBPL-202ENST00000418681 1804 ntTSL 210.65□□□□□ -0.77e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.747e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.767e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 TRIM35-204ENST00000521283 619 ntTSL 210.16□□□□□ -0.787e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.87e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.87e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.817e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 IQCB1-205ENST00000462442 602 ntTSL 39.39□□□□□ -0.917e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.917e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.967e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.057e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.057e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.067e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.077e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 POMK-202ENST00000518991 564 ntTSL 48.18□□□□□ -1.17e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NUBPL-203ENST00000547839 2001 ntTSL 28.02□□□□□ -1.137e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CHEK2-205ENST00000398017 713 ntTSL 58.02□□□□□ -1.137e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PPARG-213ENST00000477039 1705 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.137e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.141e-7■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.165e-9■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-233ENST00000524232 550 ntTSL 27.81□□□□□ -1.167e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-216ENST00000521402 596 ntTSL 47.79□□□□□ -1.167e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NUBPL-210ENST00000551314 567 ntTSL 47.78□□□□□ -1.167e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A9-206ENST00000555245 1531 ntTSL 27.73□□□□□ -1.177e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.187e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-208ENST00000596164 245 ntTSL 37.46□□□□□ -1.227e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.237e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.247e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.257e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SMIM14-203ENST00000507613 680 ntTSL 27.06□□□□□ -1.287e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.297e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.317e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 56.85□□□□□ -1.317e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.327e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 USP7-212ENST00000566004 559 ntTSL 46.76□□□□□ -1.337e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 FANCA-224ENST00000567510 461 ntTSL 36.66□□□□□ -1.347e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.355e-9■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-231ENST00000523879 650 ntTSL 56.54□□□□□ -1.367e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.387e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.387e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.47e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PIP5K1A-211ENST00000461816 449 ntTSL 56.21□□□□□ -1.427e-6■■■■□ 19.9
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