Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms