Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 SPF1YEL031W 3648 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 RIM20YOR275C 1986 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 YFH1YDL120W 525 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 YHL042WYHL042W 453 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 ABF2YMR072W 552 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 SMC6YLR383W 3345 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 COG8YML071C 1824 nt2.42□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 SIR3YLR442C 2937 nt2.41□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 ALK2YBL009W 2031 nt2.41□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.41□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 YBR277CYBR277C 402 nt2.41□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 SOK2YMR016C 2358 nt2.41□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 VPS16YPL045W 2397 nt2.41□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 HCS1YKL017C 2052 nt2.4□□□□□ -2.02
UFO1Q04511 SCP160YJL080C 3669 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 ACB1YGR037C 264 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 RPA34YJL148W 702 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 RPL38YLR325C 237 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 KTI11YBL071W-A 249 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 HHT1YBR010W 411 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YBR064WYBR064W 429 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 VMA9YCL005W-A 222 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 HDA3YPR179C 1968 nt2.4□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 TAE2YPL009C 3117 nt2.39□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 NPC2YDL046W 522 nt2.39□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.39□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 VTC3YPL019C 2508 nt2.39□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YNL018CYNL018C 1839 nt2.38□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YLL032CYLL032C 2478 nt2.38□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YNL198CYNL198C 303 nt2.38□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YPR063CYPR063C 423 nt2.38□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 NUT2YPR168W 474 nt2.38□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YBR224WYBR224W 516 nt2.38□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 SEF1YBL066C 3447 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YCK3YER123W 1575 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 DNF1YER166W 4716 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 PEX8YGR077C 1770 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 SPO22YIL073C 2928 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 TRS130YMR218C 3309 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 UPS1YLR193C 528 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YOR333CYOR333C 417 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 TFC3YAL001C 3483 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 CLN3YAL040C 1743 nt2.36□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 snR60snR60 104 nt2.35□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YRB1YDR002W 606 nt2.35□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 SNC1YAL030W 354 nt2.35□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 PCC1YKR095W-A 267 nt2.35□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 INP51YIL002C 2841 nt2.35□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YLR149CYLR149C 2193 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 APL5YPL195W 2799 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 MVP1YMR004W 1536 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 SSD1YDR293C 3753 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YGR050CYGR050C 357 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 APQ12YIL040W 417 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 HOS4YIL112W 3252 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 YBR184WYBR184W 1572 nt2.34□□□□□ -2.03
UFO1Q04511 PEP3YLR148W 2757 nt2.34□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 RIC1YLR039C 3171 nt2.34□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 STB4YMR019W 2850 nt2.34□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 NOP53YPL146C 1368 nt2.34□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 AFI1YOR129C 2682 nt2.34□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 INP53YOR109W 3324 nt2.34□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 NUP100YKL068W 2880 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 VPS34YLR240W 2628 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 CDC27YBL084C 2277 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YGR250CYGR250C 2346 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YDR426CYDR426C 378 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YLR294CYLR294C 330 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 IES4YOR189W 351 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 MDM20YOL076W 2391 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 CBF2YGR140W 2871 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 KAP123YER110C 3342 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 SAP190YKR028W 3102 nt2.33□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 SMY1YKL079W 1971 nt2.32□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 SCW11YGL028C 1629 nt2.32□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 PAM16YJL104W 450 nt2.32□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 VPH1YOR270C 2523 nt2.32□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 RRP6YOR001W 2202 nt2.32□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YEL043WYEL043W 2871 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 CSF1YLR087C 8877 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 EFR3YMR212C 2349 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 SEC16YPL085W 6588 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 NPR2YEL062W 1848 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 TIM9YEL020W-A 264 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YLR255CYLR255C 354 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 CYB5YNL111C 363 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YCL023CYCL023C 348 nt2.31□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 VMR1YHL035C 4779 nt2.3□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 GRR1YJR090C 3456 nt2.3□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 PXA2YKL188C 2562 nt2.3□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 CRM1YGR218W 3255 nt2.3□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 snR55snR55 98 nt2.3□□□□□ -2.04
UFO1Q04511 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84.6 ms