Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms