Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms