Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2BP67870 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2BP67870 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms