Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO1P63165 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SUMO1P63165 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms