Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms