Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCS1P62166 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCS1P62166 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCS1P62166 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCS1P62166 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCS1P62166 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms