Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPS3AP61247 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPS3AP61247 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPS3AP61247 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPS3AP61247 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPS3AP61247 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms