Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms