Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCL1P53675 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCL1P53675 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCL1P53675 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCL1P53675 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCL1P53675 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCL1P53675 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms