Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27AP51159 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms