Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms